Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Selenbp1P17563 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Selenbp1P17563 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Selenbp1P17563 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Selenbp1P17563 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Selenbp1P17563 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Selenbp1P17563 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Selenbp1P17563 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Selenbp1P17563 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Selenbp1P17563 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms