Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP3P12645 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms