Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI3P10071 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI3P10071 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI3P10071 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI3P10071 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI3P10071 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI3P10071 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI3P10071 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI3P10071 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI3P10071 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI3P10071 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms