Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdccag3A2AIW0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms