Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30CPA0ZSE6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30CPA0ZSE6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms