Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms