Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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