Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms