Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms