Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms