Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 NUP93-210ENST00000564887 2875 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB104A-201ENST00000314265 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB104B-201ENST00000316169 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD1-201ENST00000351325 592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P10-201ENST00000401830 930 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PHBP7-201ENST00000415677 814 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01811-202ENST00000424786 787 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TTC4P1-201ENST00000427137 1158 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4A-AS1-203ENST00000434346 833 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC008175.1-202ENST00000439653 745 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC145625.1-201ENST00000441444 592 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 IFNWP5-201ENST00000445100 588 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P29-201ENST00000482972 894 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MTND6P25-201ENST00000528711 516 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GSG1-206ENST00000537302 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC034102.1-201ENST00000552016 604 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC098850.2-201ENST00000578710 686 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A21P-201ENST00000599458 369 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL021878.2-201ENST00000602718 399 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PDZK1P1-203ENST00000616036 577 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CD200R1L-205ENST00000617549 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01206-219ENST00000625703 820 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01358-208ENST00000634569 1030 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OLMALINC-206ENST00000641799 1195 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 IL5RA-202ENST00000311981 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA9P1-201ENST00000432228 2029 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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