Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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HOXD10P28358 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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