Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC060766.6-201ENST00000589099 394 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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