Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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