Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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