Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RNF7Q9UBF6 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RNF7Q9UBF6 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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