Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms