Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SnurfQ9WU12 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnurfQ9WU12 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms