Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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