Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms