Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms