Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms