Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRQ99707 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRQ99707 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRQ99707 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRQ99707 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms