Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMG8Q8ND04 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG8Q8ND04 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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