Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgefQ8CHT1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgefQ8CHT1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms