Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LsampQ8BLK3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms