Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan9Q8BJU2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms