Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SvipQ3UZP4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms