Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms