Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
UPP1Q16831 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UPP1Q16831 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms