Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TP53BP1Q12888 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TP53BP1Q12888 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TP53BP1Q12888 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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