Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 snR161snR161 161 nt-0.22□□□□□ -2.44
ATG11Q12527 snR77snR77 88 nt-0.23□□□□□ -2.45
ATG11Q12527 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.48□□□□□ -2.49
ATG11Q12527 snR75snR75 89 nt-0.51□□□□□ -2.49
ATG11Q12527 URB1YKL014C 5295 nt-0.54□□□□□ -2.5
ATG11Q12527 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
ATG11Q12527 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
ATG11Q12527 snR40snR40 97 nt-0.7□□□□□ -2.52
ATG11Q12527 snR6snR6 112 nt-0.71□□□□□ -2.52
ATG11Q12527 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.71□□□□□ -2.52
ATG11Q12527 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.73□□□□□ -2.53
ATG11Q12527 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
ATG11Q12527 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
ATG11Q12527 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
ATG11Q12527 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
ATG11Q12527 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.82□□□□□ -2.54
ATG11Q12527 YNR077CYNR077C 255 nt-0.88□□□□□ -2.55
ATG11Q12527 snR73snR73 106 nt-0.91□□□□□ -2.56
ATG11Q12527 YOR309CYOR309C 381 nt-1.04□□□□□ -2.58
ATG11Q12527 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
ATG11Q12527 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.3□□□□□ -2.62
ATG11Q12527 snR58snR58 96 nt-1.38□□□□□ -2.63
ATG11Q12527 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.41□□□□□ -2.64
ATG11Q12527 snR87snR87 109 nt-1.61□□□□□ -2.67
ATG11Q12527 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.03□□□□□ -2.73
ATG11Q12527 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.33□□□□□ -2.78
ATG11Q12527 YDR543CYDR543C 300 nt-2.48□□□□□ -2.81
ATG11Q12527 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.32□□□□□ -2.94
ATG11Q12527 YJR162CYJR162C 351 nt-3.53□□□□□ -2.97
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 2.9 ms