Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 snR128snR128 126 nt0.48□□□□□ -2.33
SRF1Q12516 snR6snR6 112 nt0.47□□□□□ -2.33
SRF1Q12516 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.44□□□□□ -2.34
SRF1Q12516 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.44□□□□□ -2.34
SRF1Q12516 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.4□□□□□ -2.35
SRF1Q12516 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.38□□□□□ -2.35
SRF1Q12516 snR161snR161 161 nt0.34□□□□□ -2.36
SRF1Q12516 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.3□□□□□ -2.36
SRF1Q12516 snR73snR73 106 nt0.24□□□□□ -2.37
SRF1Q12516 snR58snR58 96 nt0.14□□□□□ -2.39
SRF1Q12516 URB1YKL014C 5295 nt0.11□□□□□ -2.39
SRF1Q12516 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.06□□□□□ -2.4
SRF1Q12516 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.05□□□□□ -2.4
SRF1Q12516 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.11□□□□□ -2.43
SRF1Q12516 YNR077CYNR077C 255 nt-0.14□□□□□ -2.43
SRF1Q12516 YOR309CYOR309C 381 nt-0.31□□□□□ -2.46
SRF1Q12516 snR87snR87 109 nt-0.39□□□□□ -2.47
SRF1Q12516 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
SRF1Q12516 snR33snR33 183 nt-0.5□□□□□ -2.49
SRF1Q12516 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
SRF1Q12516 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
SRF1Q12516 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
SRF1Q12516 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
SRF1Q12516 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.94□□□□□ -2.56
SRF1Q12516 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.47□□□□□ -2.64
SRF1Q12516 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.84□□□□□ -2.7
SRF1Q12516 YDR543CYDR543C 300 nt-1.91□□□□□ -2.72
SRF1Q12516 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.26□□□□□ -2.77
SRF1Q12516 YJR162CYJR162C 351 nt-3.09□□□□□ -2.9
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