Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.06□□□□□ -2.4
TRM13Q12383 snR161snR161 161 nt-0.03□□□□□ -2.41
TRM13Q12383 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.17□□□□□ -2.44
TRM13Q12383 snR40snR40 97 nt-0.21□□□□□ -2.44
TRM13Q12383 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.36□□□□□ -2.47
TRM13Q12383 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.4□□□□□ -2.47
TRM13Q12383 URB1YKL014C 5295 nt-0.45□□□□□ -2.48
TRM13Q12383 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.45□□□□□ -2.48
TRM13Q12383 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.45□□□□□ -2.48
TRM13Q12383 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.45□□□□□ -2.48
TRM13Q12383 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
TRM13Q12383 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.51□□□□□ -2.49
TRM13Q12383 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.54□□□□□ -2.5
TRM13Q12383 snR6snR6 112 nt-0.55□□□□□ -2.5
TRM13Q12383 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
TRM13Q12383 snR73snR73 106 nt-0.69□□□□□ -2.52
TRM13Q12383 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
TRM13Q12383 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.75□□□□□ -2.53
TRM13Q12383 snR58snR58 96 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRM13Q12383 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.81□□□□□ -2.54
TRM13Q12383 YNR077CYNR077C 255 nt-0.89□□□□□ -2.55
TRM13Q12383 YOR309CYOR309C 381 nt-0.91□□□□□ -2.56
TRM13Q12383 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.1□□□□□ -2.59
TRM13Q12383 snR87snR87 109 nt-1.32□□□□□ -2.62
TRM13Q12383 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.4□□□□□ -2.63
TRM13Q12383 YDR543CYDR543C 300 nt-1.64□□□□□ -2.67
TRM13Q12383 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.92□□□□□ -2.72
TRM13Q12383 YJR162CYJR162C 351 nt-2.39□□□□□ -2.79
TRM13Q12383 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.79□□□□□ -2.86
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4.7 ms