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Protein–RNA interactions for Protein: Q12324
YVC1, Calcium channel YVC1, yeast
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675 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
YVC1
Q12324
snR40
snR40
97 nt
0.2
□□□□□ -2.38
YVC1
Q12324
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
0.16
□□□□□ -2.38
YVC1
Q12324
snR161
snR161
161 nt
0.06
□□□□□ -2.4
YVC1
Q12324
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
YVC1
Q12324
RPL41B
YDL133C-A
78 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
YVC1
Q12324
YOR335W-A
YOR335W-A
81 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
YVC1
Q12324
snR6
snR6
112 nt
-0.26
□□□□□ -2.45
YVC1
Q12324
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
YVC1
Q12324
snR73
snR73
106 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
YVC1
Q12324
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
YVC1
Q12324
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
YVC1
Q12324
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
YVC1
Q12324
tC(GCA)Q
tC(GCA)Q
76 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
YVC1
Q12324
snR33
snR33
183 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
YVC1
Q12324
snR58
snR58
96 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
YVC1
Q12324
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
YVC1
Q12324
YOR309C
YOR309C
381 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
YVC1
Q12324
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
YVC1
Q12324
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
YVC1
Q12324
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
YVC1
Q12324
snR87
snR87
109 nt
-1.1
□□□□□ -2.59
YVC1
Q12324
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-1.13
□□□□□ -2.59
YVC1
Q12324
YNR077C
YNR077C
255 nt
-1.24
□□□□□ -2.61
YVC1
Q12324
YBR223W-A
YBR223W-A
120 nt
-1.24
□□□□□ -2.61
YVC1
Q12324
YBR126W-B
YBR126W-B
144 nt
-1.99
□□□□□ -2.73
YVC1
Q12324
YJL136W-A
YJL136W-A
84 nt
-2.8
□□□□□ -2.86
YVC1
Q12324
YDR543C
YDR543C
300 nt
-2.91
□□□□□ -2.88
YVC1
Q12324
YOL166W-A
YOL166W-A
156 nt
-2.92
□□□□□ -2.88
YVC1
Q12324
YJR162C
YJR162C
351 nt
-3.89
□□□□□ -3.03
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