Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 snR77snR77 88 nt-0.3□□□□□ -2.46
CLF1Q12309 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.4□□□□□ -2.47
CLF1Q12309 URB1YKL014C 5295 nt-0.6□□□□□ -2.51
CLF1Q12309 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.61□□□□□ -2.51
CLF1Q12309 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
CLF1Q12309 snR33snR33 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
CLF1Q12309 snR6snR6 112 nt-0.73□□□□□ -2.53
CLF1Q12309 snR75snR75 89 nt-0.73□□□□□ -2.53
CLF1Q12309 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
CLF1Q12309 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.77□□□□□ -2.53
CLF1Q12309 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.79□□□□□ -2.54
CLF1Q12309 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
CLF1Q12309 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
CLF1Q12309 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
CLF1Q12309 snR40snR40 97 nt-0.84□□□□□ -2.54
CLF1Q12309 snR73snR73 106 nt-0.94□□□□□ -2.56
CLF1Q12309 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.94□□□□□ -2.56
CLF1Q12309 YOR309CYOR309C 381 nt-1.06□□□□□ -2.58
CLF1Q12309 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.13□□□□□ -2.59
CLF1Q12309 YNR077CYNR077C 255 nt-1.3□□□□□ -2.62
CLF1Q12309 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.33□□□□□ -2.62
CLF1Q12309 snR58snR58 96 nt-1.49□□□□□ -2.65
CLF1Q12309 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.53□□□□□ -2.65
CLF1Q12309 snR87snR87 109 nt-1.66□□□□□ -2.68
CLF1Q12309 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.13□□□□□ -2.75
CLF1Q12309 YDR543CYDR543C 300 nt-2.58□□□□□ -2.82
CLF1Q12309 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.82□□□□□ -2.86
CLF1Q12309 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.38□□□□□ -2.95
CLF1Q12309 YJR162CYJR162C 351 nt-3.73□□□□□ -3.01
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.6 ms