Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 snR161snR161 161 nt-0.08□□□□□ -2.42
TAF3Q12297 YOL014WYOL014W 375 nt-0.18□□□□□ -2.44
TAF3Q12297 snR40snR40 97 nt-0.32□□□□□ -2.46
TAF3Q12297 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.42□□□□□ -2.48
TAF3Q12297 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.48□□□□□ -2.49
TAF3Q12297 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
TAF3Q12297 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.51□□□□□ -2.49
TAF3Q12297 snR6snR6 112 nt-0.53□□□□□ -2.49
TAF3Q12297 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.55□□□□□ -2.5
TAF3Q12297 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
TAF3Q12297 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
TAF3Q12297 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
TAF3Q12297 snR73snR73 106 nt-0.67□□□□□ -2.52
TAF3Q12297 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.73□□□□□ -2.53
TAF3Q12297 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
TAF3Q12297 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
TAF3Q12297 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
TAF3Q12297 YOR309CYOR309C 381 nt-0.86□□□□□ -2.55
TAF3Q12297 snR58snR58 96 nt-0.99□□□□□ -2.57
TAF3Q12297 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.99□□□□□ -2.57
TAF3Q12297 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.12□□□□□ -2.59
TAF3Q12297 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.28□□□□□ -2.61
TAF3Q12297 snR87snR87 109 nt-1.29□□□□□ -2.62
TAF3Q12297 YNR077CYNR077C 255 nt-1.75□□□□□ -2.69
TAF3Q12297 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.96□□□□□ -2.72
TAF3Q12297 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.77□□□□□ -2.85
TAF3Q12297 YDR543CYDR543C 300 nt-2.94□□□□□ -2.88
TAF3Q12297 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.43□□□□□ -2.96
TAF3Q12297 YJR162CYJR162C 351 nt-3.91□□□□□ -3.04
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.9 ms