Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 snR77snR77 88 nt-0.14□□□□□ -2.43
HER1Q12276 snR161snR161 161 nt-0.18□□□□□ -2.44
HER1Q12276 snR75snR75 89 nt-0.32□□□□□ -2.46
HER1Q12276 URB1YKL014C 5295 nt-0.39□□□□□ -2.47
HER1Q12276 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.42□□□□□ -2.48
HER1Q12276 snR33snR33 183 nt-0.49□□□□□ -2.49
HER1Q12276 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
HER1Q12276 YNR077CYNR077C 255 nt-0.51□□□□□ -2.49
HER1Q12276 snR40snR40 97 nt-0.54□□□□□ -2.5
HER1Q12276 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
HER1Q12276 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
HER1Q12276 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.55□□□□□ -2.5
HER1Q12276 snR6snR6 112 nt-0.57□□□□□ -2.5
HER1Q12276 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
HER1Q12276 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.6□□□□□ -2.51
HER1Q12276 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.62□□□□□ -2.51
HER1Q12276 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.62□□□□□ -2.51
HER1Q12276 snR73snR73 106 nt-0.73□□□□□ -2.53
HER1Q12276 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.77□□□□□ -2.53
HER1Q12276 YOR309CYOR309C 381 nt-0.87□□□□□ -2.55
HER1Q12276 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.93□□□□□ -2.56
HER1Q12276 snR58snR58 96 nt-1.02□□□□□ -2.57
HER1Q12276 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.06□□□□□ -2.58
HER1Q12276 snR87snR87 109 nt-1.32□□□□□ -2.62
HER1Q12276 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.36□□□□□ -2.63
HER1Q12276 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.71□□□□□ -2.68
HER1Q12276 YDR543CYDR543C 300 nt-1.79□□□□□ -2.7
HER1Q12276 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.5□□□□□ -2.81
HER1Q12276 YJR162CYJR162C 351 nt-2.51□□□□□ -2.81
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.9 ms