Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 snR77snR77 88 nt0.04□□□□□ -2.4
SVS1Q12254 snR161snR161 161 nt-0.12□□□□□ -2.43
SVS1Q12254 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.12□□□□□ -2.43
SVS1Q12254 snR40snR40 97 nt-0.32□□□□□ -2.46
SVS1Q12254 URB1YKL014C 5295 nt-0.35□□□□□ -2.47
SVS1Q12254 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.42□□□□□ -2.48
SVS1Q12254 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
SVS1Q12254 snR6snR6 112 nt-0.52□□□□□ -2.49
SVS1Q12254 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.54□□□□□ -2.5
SVS1Q12254 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.58□□□□□ -2.5
SVS1Q12254 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.65□□□□□ -2.51
SVS1Q12254 snR33snR33 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
SVS1Q12254 snR73snR73 106 nt-0.72□□□□□ -2.52
SVS1Q12254 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
SVS1Q12254 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
SVS1Q12254 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
SVS1Q12254 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
SVS1Q12254 YOR309CYOR309C 381 nt-0.98□□□□□ -2.57
SVS1Q12254 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.01□□□□□ -2.57
SVS1Q12254 snR58snR58 96 nt-1.03□□□□□ -2.57
SVS1Q12254 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.03□□□□□ -2.57
SVS1Q12254 YNR077CYNR077C 255 nt-1.04□□□□□ -2.58
SVS1Q12254 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.27□□□□□ -2.61
SVS1Q12254 snR87snR87 109 nt-1.45□□□□□ -2.64
SVS1Q12254 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.98□□□□□ -2.73
SVS1Q12254 YDR543CYDR543C 300 nt-2.33□□□□□ -2.78
SVS1Q12254 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.44□□□□□ -2.8
SVS1Q12254 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.23□□□□□ -2.93
SVS1Q12254 YJR162CYJR162C 351 nt-3.43□□□□□ -2.96
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