Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.16□□□□□ -2.38
YLL054CQ12244 snR40snR40 97 nt0.06□□□□□ -2.4
YLL054CQ12244 snR161snR161 161 nt-0.02□□□□□ -2.41
YLL054CQ12244 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.07□□□□□ -2.42
YLL054CQ12244 snR6snR6 112 nt-0.25□□□□□ -2.45
YLL054CQ12244 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.27□□□□□ -2.45
YLL054CQ12244 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.36□□□□□ -2.47
YLL054CQ12244 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.45□□□□□ -2.48
YLL054CQ12244 snR73snR73 106 nt-0.47□□□□□ -2.48
YLL054CQ12244 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.53□□□□□ -2.49
YLL054CQ12244 URB1YKL014C 5295 nt-0.53□□□□□ -2.49
YLL054CQ12244 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.53□□□□□ -2.49
YLL054CQ12244 snR33snR33 183 nt-0.65□□□□□ -2.51
YLL054CQ12244 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
YLL054CQ12244 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
YLL054CQ12244 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
YLL054CQ12244 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
YLL054CQ12244 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLL054CQ12244 YOR309CYOR309C 381 nt-0.79□□□□□ -2.54
YLL054CQ12244 snR58snR58 96 nt-0.88□□□□□ -2.55
YLL054CQ12244 YNR077CYNR077C 255 nt-0.88□□□□□ -2.55
YLL054CQ12244 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.96□□□□□ -2.56
YLL054CQ12244 snR87snR87 109 nt-1.2□□□□□ -2.6
YLL054CQ12244 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.23□□□□□ -2.61
YLL054CQ12244 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.84□□□□□ -2.7
YLL054CQ12244 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.2□□□□□ -2.76
YLL054CQ12244 YDR543CYDR543C 300 nt-2.22□□□□□ -2.76
YLL054CQ12244 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.11□□□□□ -2.91
YLL054CQ12244 YJR162CYJR162C 351 nt-3.3□□□□□ -2.94
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 111.9 ms