Protein–RNA interactions for Protein: Q12198

YLL058W, Putative cystathionine gamma-synthase YLL058W, yeastyeast

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL058WQ12198 snR161snR161 161 nt-0.2□□□□□ -2.44
YLL058WQ12198 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.34□□□□□ -2.46
YLL058WQ12198 snR75snR75 89 nt-0.43□□□□□ -2.48
YLL058WQ12198 URB1YKL014C 5295 nt-0.46□□□□□ -2.48
YLL058WQ12198 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
YLL058WQ12198 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.63□□□□□ -2.51
YLL058WQ12198 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
YLL058WQ12198 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
YLL058WQ12198 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
YLL058WQ12198 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
YLL058WQ12198 snR40snR40 97 nt-0.69□□□□□ -2.52
YLL058WQ12198 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
YLL058WQ12198 snR6snR6 112 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLL058WQ12198 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.76□□□□□ -2.53
YLL058WQ12198 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.78□□□□□ -2.53
YLL058WQ12198 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.81□□□□□ -2.54
YLL058WQ12198 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
YLL058WQ12198 snR73snR73 106 nt-0.96□□□□□ -2.56
YLL058WQ12198 YNR077CYNR077C 255 nt-0.99□□□□□ -2.57
YLL058WQ12198 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.1□□□□□ -2.59
YLL058WQ12198 YOR309CYOR309C 381 nt-1.13□□□□□ -2.59
YLL058WQ12198 snR58snR58 96 nt-1.42□□□□□ -2.64
YLL058WQ12198 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.45□□□□□ -2.64
YLL058WQ12198 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.66□□□□□ -2.68
YLL058WQ12198 snR87snR87 109 nt-1.73□□□□□ -2.69
YLL058WQ12198 YDR543CYDR543C 300 nt-2.16□□□□□ -2.76
YLL058WQ12198 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.21□□□□□ -2.76
YLL058WQ12198 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.94□□□□□ -2.88
YLL058WQ12198 YJR162CYJR162C 351 nt-3.05□□□□□ -2.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms