Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.09□□□□□ -2.4
MSL5Q12186 snR40snR40 97 nt0.09□□□□□ -2.4
MSL5Q12186 snR161snR161 161 nt0.06□□□□□ -2.4
MSL5Q12186 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.17□□□□□ -2.44
MSL5Q12186 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.23□□□□□ -2.45
MSL5Q12186 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.23□□□□□ -2.45
MSL5Q12186 snR6snR6 112 nt-0.32□□□□□ -2.46
MSL5Q12186 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
MSL5Q12186 URB1YKL014C 5295 nt-0.35□□□□□ -2.47
MSL5Q12186 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.36□□□□□ -2.47
MSL5Q12186 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.4□□□□□ -2.47
MSL5Q12186 snR73snR73 106 nt-0.42□□□□□ -2.48
MSL5Q12186 snR33snR33 183 nt-0.49□□□□□ -2.49
MSL5Q12186 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
MSL5Q12186 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.58□□□□□ -2.5
MSL5Q12186 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
MSL5Q12186 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
MSL5Q12186 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
MSL5Q12186 YNR077CYNR077C 255 nt-0.62□□□□□ -2.51
MSL5Q12186 snR58snR58 96 nt-0.65□□□□□ -2.51
MSL5Q12186 YOR309CYOR309C 381 nt-0.65□□□□□ -2.51
MSL5Q12186 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.84□□□□□ -2.54
MSL5Q12186 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.96□□□□□ -2.56
MSL5Q12186 snR87snR87 109 nt-0.97□□□□□ -2.56
MSL5Q12186 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.55□□□□□ -2.66
MSL5Q12186 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.91□□□□□ -2.72
MSL5Q12186 YDR543CYDR543C 300 nt-1.95□□□□□ -2.72
MSL5Q12186 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.36□□□□□ -2.79
MSL5Q12186 YJR162CYJR162C 351 nt-2.69□□□□□ -2.84
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.6 ms