Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.37□□□□□ -2.47
MCD1Q12158 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.41□□□□□ -2.47
MCD1Q12158 URB1YKL014C 5295 nt-0.52□□□□□ -2.49
MCD1Q12158 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.64□□□□□ -2.51
MCD1Q12158 snR33snR33 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
MCD1Q12158 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
MCD1Q12158 snR75snR75 89 nt-0.8□□□□□ -2.54
MCD1Q12158 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
MCD1Q12158 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
MCD1Q12158 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
MCD1Q12158 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
MCD1Q12158 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.92□□□□□ -2.56
MCD1Q12158 snR6snR6 112 nt-0.96□□□□□ -2.56
MCD1Q12158 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.01□□□□□ -2.57
MCD1Q12158 snR40snR40 97 nt-1.03□□□□□ -2.57
MCD1Q12158 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.04□□□□□ -2.58
MCD1Q12158 YNR077CYNR077C 255 nt-1.13□□□□□ -2.59
MCD1Q12158 YOR309CYOR309C 381 nt-1.2□□□□□ -2.6
MCD1Q12158 snR73snR73 106 nt-1.21□□□□□ -2.6
MCD1Q12158 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.24□□□□□ -2.61
MCD1Q12158 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.28□□□□□ -2.61
MCD1Q12158 snR58snR58 96 nt-1.7□□□□□ -2.68
MCD1Q12158 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.77□□□□□ -2.69
MCD1Q12158 snR87snR87 109 nt-1.87□□□□□ -2.71
MCD1Q12158 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.07□□□□□ -2.74
MCD1Q12158 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.83□□□□□ -2.86
MCD1Q12158 YDR543CYDR543C 300 nt-2.88□□□□□ -2.87
MCD1Q12158 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.32□□□□□ -2.94
MCD1Q12158 YJR162CYJR162C 351 nt-4.06□□□□□ -3.06
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.9 ms