Protein–RNA interactions for Protein: Q12132

USV1, Nutrient and stress factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USV1Q12132 snR161snR161 161 nt-0.24□□□□□ -2.45
USV1Q12132 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.3□□□□□ -2.46
USV1Q12132 URB1YKL014C 5295 nt-0.39□□□□□ -2.47
USV1Q12132 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.41□□□□□ -2.47
USV1Q12132 snR75snR75 89 nt-0.52□□□□□ -2.49
USV1Q12132 snR33snR33 183 nt-0.58□□□□□ -2.5
USV1Q12132 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.61□□□□□ -2.51
USV1Q12132 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.61□□□□□ -2.51
USV1Q12132 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.61□□□□□ -2.51
USV1Q12132 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
USV1Q12132 snR6snR6 112 nt-0.73□□□□□ -2.53
USV1Q12132 snR40snR40 97 nt-0.74□□□□□ -2.53
USV1Q12132 YNR077CYNR077C 255 nt-0.76□□□□□ -2.53
USV1Q12132 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.77□□□□□ -2.53
USV1Q12132 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.77□□□□□ -2.53
USV1Q12132 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.78□□□□□ -2.53
USV1Q12132 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
USV1Q12132 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
USV1Q12132 snR73snR73 106 nt-0.93□□□□□ -2.56
USV1Q12132 YOR309CYOR309C 381 nt-1.09□□□□□ -2.58
USV1Q12132 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.1□□□□□ -2.59
USV1Q12132 snR58snR58 96 nt-1.25□□□□□ -2.61
USV1Q12132 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.32□□□□□ -2.62
USV1Q12132 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.54□□□□□ -2.66
USV1Q12132 snR87snR87 109 nt-1.63□□□□□ -2.67
USV1Q12132 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.88□□□□□ -2.71
USV1Q12132 YDR543CYDR543C 300 nt-1.94□□□□□ -2.72
USV1Q12132 YJR162CYJR162C 351 nt-2.7□□□□□ -2.84
USV1Q12132 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.05□□□□□ -2.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms