Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.47□□□□□ -2.33
NOP53Q12080 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.39□□□□□ -2.35
NOP53Q12080 snR161snR161 161 nt0.36□□□□□ -2.35
NOP53Q12080 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.22□□□□□ -2.37
NOP53Q12080 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.16□□□□□ -2.38
NOP53Q12080 snR6snR6 112 nt0.12□□□□□ -2.39
NOP53Q12080 YJL113WYJL113W 4647 nt0.1□□□□□ -2.39
NOP53Q12080 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.06□□□□□ -2.42
NOP53Q12080 snR73snR73 106 nt-0.09□□□□□ -2.42
NOP53Q12080 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.19□□□□□ -2.44
NOP53Q12080 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.26□□□□□ -2.45
NOP53Q12080 snR58snR58 96 nt-0.3□□□□□ -2.46
NOP53Q12080 URB1YKL014C 5295 nt-0.41□□□□□ -2.47
NOP53Q12080 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
NOP53Q12080 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
NOP53Q12080 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
NOP53Q12080 snR33snR33 183 nt-0.59□□□□□ -2.5
NOP53Q12080 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.62□□□□□ -2.51
NOP53Q12080 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
NOP53Q12080 YNR077CYNR077C 255 nt-0.64□□□□□ -2.51
NOP53Q12080 YOR309CYOR309C 381 nt-0.66□□□□□ -2.52
NOP53Q12080 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.88□□□□□ -2.55
NOP53Q12080 snR87snR87 109 nt-0.92□□□□□ -2.56
NOP53Q12080 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.15□□□□□ -2.59
NOP53Q12080 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.62□□□□□ -2.67
NOP53Q12080 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.63□□□□□ -2.67
NOP53Q12080 YDR543CYDR543C 300 nt-2.01□□□□□ -2.73
NOP53Q12080 YJR162CYJR162C 351 nt-2.84□□□□□ -2.86
NOP53Q12080 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.13□□□□□ -2.91
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 43 ms