Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
PUS9Q12069 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.21□□□□□ -2.38
PUS9Q12069 snR161snR161 161 nt0.19□□□□□ -2.38
PUS9Q12069 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.09□□□□□ -2.4
PUS9Q12069 snR6snR6 112 nt0.04□□□□□ -2.4
PUS9Q12069 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.04□□□□□ -2.4
PUS9Q12069 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.07□□□□□ -2.42
PUS9Q12069 snR73snR73 106 nt-0.1□□□□□ -2.43
PUS9Q12069 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.13□□□□□ -2.43
PUS9Q12069 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.14□□□□□ -2.43
PUS9Q12069 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.18□□□□□ -2.44
PUS9Q12069 snR58snR58 96 nt-0.27□□□□□ -2.45
PUS9Q12069 URB1YKL014C 5295 nt-0.3□□□□□ -2.46
PUS9Q12069 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.36□□□□□ -2.47
PUS9Q12069 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.38□□□□□ -2.47
PUS9Q12069 YOR309CYOR309C 381 nt-0.41□□□□□ -2.48
PUS9Q12069 snR33snR33 183 nt-0.44□□□□□ -2.48
PUS9Q12069 snR87snR87 109 nt-0.6□□□□□ -2.51
PUS9Q12069 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
PUS9Q12069 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
PUS9Q12069 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
PUS9Q12069 YNR077CYNR077C 255 nt-0.72□□□□□ -2.52
PUS9Q12069 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.83□□□□□ -2.54
PUS9Q12069 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.84□□□□□ -2.54
PUS9Q12069 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.62□□□□□ -2.67
PUS9Q12069 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.79□□□□□ -2.7
PUS9Q12069 YDR543CYDR543C 300 nt-1.9□□□□□ -2.71
PUS9Q12069 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2□□□□□ -2.73
PUS9Q12069 YJR162CYJR162C 351 nt-2.91□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.2 ms