Protein–RNA interactions for Protein: Q12015

YOR223W, Transmembrane protein YOR223W, yeastyeast

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR223WQ12015 snR40snR40 97 nt0.2□□□□□ -2.38
YOR223WQ12015 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.17□□□□□ -2.38
YOR223WQ12015 snR161snR161 161 nt0.05□□□□□ -2.4
YOR223WQ12015 YJL113WYJL113W 4647 nt0.01□□□□□ -2.41
YOR223WQ12015 snR6snR6 112 nt-0.22□□□□□ -2.44
YOR223WQ12015 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.24□□□□□ -2.45
YOR223WQ12015 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.28□□□□□ -2.45
YOR223WQ12015 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
YOR223WQ12015 snR73snR73 106 nt-0.43□□□□□ -2.48
YOR223WQ12015 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.47□□□□□ -2.48
YOR223WQ12015 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.48□□□□□ -2.49
YOR223WQ12015 URB1YKL014C 5295 nt-0.5□□□□□ -2.49
YOR223WQ12015 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
YOR223WQ12015 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
YOR223WQ12015 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
YOR223WQ12015 snR33snR33 183 nt-0.61□□□□□ -2.51
YOR223WQ12015 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.62□□□□□ -2.51
YOR223WQ12015 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
YOR223WQ12015 snR58snR58 96 nt-0.69□□□□□ -2.52
YOR223WQ12015 YOR309CYOR309C 381 nt-0.76□□□□□ -2.53
YOR223WQ12015 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.76□□□□□ -2.53
YOR223WQ12015 YNR077CYNR077C 255 nt-0.82□□□□□ -2.54
YOR223WQ12015 snR87snR87 109 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOR223WQ12015 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.17□□□□□ -2.6
YOR223WQ12015 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.54□□□□□ -2.66
YOR223WQ12015 YDR543CYDR543C 300 nt-1.69□□□□□ -2.68
YOR223WQ12015 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.78□□□□□ -2.69
YOR223WQ12015 YJR162CYJR162C 351 nt-2.51□□□□□ -2.81
YOR223WQ12015 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.91□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.5 ms