Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.44□□□□□ -2.34
TFB4Q12004 YJL113WYJL113W 4647 nt0.42□□□□□ -2.34
TFB4Q12004 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.39□□□□□ -2.35
TFB4Q12004 snR161snR161 161 nt0.35□□□□□ -2.35
TFB4Q12004 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.22□□□□□ -2.37
TFB4Q12004 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.22□□□□□ -2.37
TFB4Q12004 snR6snR6 112 nt0.19□□□□□ -2.38
TFB4Q12004 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.07□□□□□ -2.4
TFB4Q12004 snR73snR73 106 nt-0.04□□□□□ -2.42
TFB4Q12004 snR58snR58 96 nt-0.14□□□□□ -2.43
TFB4Q12004 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.14□□□□□ -2.43
TFB4Q12004 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.22□□□□□ -2.44
TFB4Q12004 URB1YKL014C 5295 nt-0.24□□□□□ -2.45
TFB4Q12004 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.29□□□□□ -2.46
TFB4Q12004 YOR309CYOR309C 381 nt-0.57□□□□□ -2.5
TFB4Q12004 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
TFB4Q12004 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
TFB4Q12004 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
TFB4Q12004 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
TFB4Q12004 snR33snR33 183 nt-0.61□□□□□ -2.51
TFB4Q12004 snR87snR87 109 nt-0.78□□□□□ -2.53
TFB4Q12004 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.79□□□□□ -2.54
TFB4Q12004 YNR077CYNR077C 255 nt-0.97□□□□□ -2.56
TFB4Q12004 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.14□□□□□ -2.59
TFB4Q12004 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.59□□□□□ -2.66
TFB4Q12004 YDR543CYDR543C 300 nt-1.85□□□□□ -2.71
TFB4Q12004 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.98□□□□□ -2.73
TFB4Q12004 YJR162CYJR162C 351 nt-2.62□□□□□ -2.83
TFB4Q12004 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.89□□□□□ -2.87
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 82 ms