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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
Predictions only
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590 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
snR77
snR77
88 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SGO1
Q08490
snR75
snR75
89 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
SGO1
Q08490
snR161
snR161
161 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
SGO1
Q08490
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.29
□□□□□ -2.46
SGO1
Q08490
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.37
□□□□□ -2.47
SGO1
Q08490
snR40
snR40
97 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
SGO1
Q08490
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
SGO1
Q08490
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
SGO1
Q08490
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
SGO1
Q08490
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
SGO1
Q08490
snR6
snR6
112 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
SGO1
Q08490
YOR335W-A
YOR335W-A
81 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
SGO1
Q08490
YNR077C
YNR077C
255 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
SGO1
Q08490
RPL41B
YDL133C-A
78 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SGO1
Q08490
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SGO1
Q08490
snR33
snR33
183 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SGO1
Q08490
YBR223W-A
YBR223W-A
120 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
SGO1
Q08490
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
SGO1
Q08490
snR73
snR73
106 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
SGO1
Q08490
YOR309C
YOR309C
381 nt
-0.91
□□□□□ -2.56
SGO1
Q08490
snR58
snR58
96 nt
-1.11
□□□□□ -2.59
SGO1
Q08490
tC(GCA)Q
tC(GCA)Q
76 nt
-1.11
□□□□□ -2.59
SGO1
Q08490
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-1.18
□□□□□ -2.6
SGO1
Q08490
YOL166W-A
YOL166W-A
156 nt
-1.35
□□□□□ -2.63
SGO1
Q08490
snR87
snR87
109 nt
-1.39
□□□□□ -2.63
SGO1
Q08490
YBR126W-B
YBR126W-B
144 nt
-1.41
□□□□□ -2.64
SGO1
Q08490
YDR543C
YDR543C
300 nt
-1.45
□□□□□ -2.64
SGO1
Q08490
YJR162C
YJR162C
351 nt
-2.19
□□□□□ -2.76
SGO1
Q08490
YJL136W-A
YJL136W-A
84 nt
-2.99
□□□□□ -2.89
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