Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 snR77snR77 88 nt-0.22□□□□□ -2.44
HRQ1Q05549 snR161snR161 161 nt-0.22□□□□□ -2.44
HRQ1Q05549 URB1YKL014C 5295 nt-0.37□□□□□ -2.47
HRQ1Q05549 snR75snR75 89 nt-0.44□□□□□ -2.48
HRQ1Q05549 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.49□□□□□ -2.49
HRQ1Q05549 YNR077CYNR077C 255 nt-0.69□□□□□ -2.52
HRQ1Q05549 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
HRQ1Q05549 snR33snR33 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
HRQ1Q05549 snR40snR40 97 nt-0.75□□□□□ -2.53
HRQ1Q05549 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.76□□□□□ -2.53
HRQ1Q05549 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
HRQ1Q05549 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
HRQ1Q05549 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
HRQ1Q05549 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.82□□□□□ -2.54
HRQ1Q05549 snR6snR6 112 nt-0.85□□□□□ -2.55
HRQ1Q05549 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.87□□□□□ -2.55
HRQ1Q05549 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.93□□□□□ -2.56
HRQ1Q05549 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.03□□□□□ -2.57
HRQ1Q05549 snR73snR73 106 nt-1.05□□□□□ -2.58
HRQ1Q05549 YOR309CYOR309C 381 nt-1.23□□□□□ -2.61
HRQ1Q05549 snR58snR58 96 nt-1.34□□□□□ -2.62
HRQ1Q05549 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.37□□□□□ -2.63
HRQ1Q05549 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.41□□□□□ -2.64
HRQ1Q05549 snR87snR87 109 nt-1.84□□□□□ -2.7
HRQ1Q05549 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.96□□□□□ -2.72
HRQ1Q05549 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.2□□□□□ -2.76
HRQ1Q05549 YDR543CYDR543C 300 nt-2.35□□□□□ -2.79
HRQ1Q05549 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.63□□□□□ -2.99
HRQ1Q05549 YJR162CYJR162C 351 nt-3.63□□□□□ -2.99
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